Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA3P32297 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHRNA3P32297 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHRNA3P32297 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA3P32297 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA3P32297 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA3P32297 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA3P32297 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA3P32297 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA3P32297 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA3P32297 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA3P32297 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA3P32297 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA3P32297 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA3P32297 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA3P32297 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA3P32297 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA3P32297 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHRNA3P32297 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms