Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRS3P32247 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRS3P32247 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRS3P32247 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRS3P32247 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BRS3P32247 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BRS3P32247 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRS3P32247 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRS3P32247 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRS3P32247 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRS3P32247 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRS3P32247 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BRS3P32247 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BRS3P32247 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRS3P32247 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRS3P32247 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRS3P32247 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRS3P32247 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRS3P32247 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRS3P32247 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRS3P32247 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRS3P32247 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRS3P32247 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRS3P32247 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRS3P32247 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRS3P32247 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRS3P32247 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRS3P32247 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRS3P32247 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRS3P32247 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRS3P32247 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BRS3P32247 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BRS3P32247 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRS3P32247 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRS3P32247 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRS3P32247 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRS3P32247 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRS3P32247 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRS3P32247 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRS3P32247 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRS3P32247 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRS3P32247 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRS3P32247 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRS3P32247 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BRS3P32247 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRS3P32247 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BRS3P32247 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BRS3P32247 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BRS3P32247 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRS3P32247 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRS3P32247 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRS3P32247 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BRS3P32247 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRS3P32247 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRS3P32247 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRS3P32247 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRS3P32247 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRS3P32247 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRS3P32247 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRS3P32247 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRS3P32247 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BRS3P32247 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRS3P32247 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRS3P32247 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRS3P32247 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRS3P32247 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRS3P32247 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRS3P32247 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRS3P32247 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
BRS3P32247 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRS3P32247 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRS3P32247 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRS3P32247 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRS3P32247 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRS3P32247 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRS3P32247 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BRS3P32247 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRS3P32247 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BRS3P32247 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRS3P32247 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRS3P32247 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRS3P32247 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRS3P32247 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRS3P32247 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRS3P32247 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRS3P32247 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRS3P32247 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRS3P32247 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRS3P32247 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRS3P32247 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRS3P32247 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRS3P32247 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRS3P32247 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRS3P32247 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRS3P32247 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRS3P32247 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRS3P32247 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRS3P32247 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRS3P32247 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRS3P32247 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms