Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRIP30626 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRIP30626 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRIP30626 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRIP30626 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRIP30626 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRIP30626 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRIP30626 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRIP30626 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRIP30626 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRIP30626 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRIP30626 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRIP30626 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRIP30626 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRIP30626 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRIP30626 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRIP30626 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRIP30626 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRIP30626 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRIP30626 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRIP30626 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRIP30626 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRIP30626 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRIP30626 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRIP30626 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRIP30626 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRIP30626 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRIP30626 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SRIP30626 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRIP30626 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRIP30626 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRIP30626 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRIP30626 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRIP30626 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRIP30626 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRIP30626 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRIP30626 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRIP30626 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRIP30626 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRIP30626 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRIP30626 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRIP30626 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SRIP30626 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRIP30626 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SRIP30626 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRIP30626 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRIP30626 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SRIP30626 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SRIP30626 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRIP30626 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRIP30626 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRIP30626 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRIP30626 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRIP30626 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRIP30626 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRIP30626 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRIP30626 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRIP30626 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRIP30626 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRIP30626 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRIP30626 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRIP30626 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRIP30626 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRIP30626 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRIP30626 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRIP30626 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRIP30626 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRIP30626 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRIP30626 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRIP30626 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRIP30626 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRIP30626 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRIP30626 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRIP30626 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRIP30626 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRIP30626 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRIP30626 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRIP30626 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRIP30626 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRIP30626 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRIP30626 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRIP30626 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRIP30626 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRIP30626 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRIP30626 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRIP30626 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRIP30626 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRIP30626 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRIP30626 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRIP30626 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SRIP30626 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRIP30626 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRIP30626 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRIP30626 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRIP30626 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRIP30626 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRIP30626 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRIP30626 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRIP30626 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRIP30626 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.7 ms