Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMOD1P29536 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMOD1P29536 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
LMOD1P29536 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LMOD1P29536 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMOD1P29536 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LMOD1P29536 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMOD1P29536 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMOD1P29536 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMOD1P29536 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMOD1P29536 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD1P29536 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMOD1P29536 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMOD1P29536 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMOD1P29536 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMOD1P29536 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMOD1P29536 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMOD1P29536 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMOD1P29536 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMOD1P29536 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMOD1P29536 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMOD1P29536 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
LMOD1P29536 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMOD1P29536 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMOD1P29536 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMOD1P29536 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMOD1P29536 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMOD1P29536 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
LMOD1P29536 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMOD1P29536 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMOD1P29536 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMOD1P29536 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMOD1P29536 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMOD1P29536 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMOD1P29536 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMOD1P29536 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LMOD1P29536 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LMOD1P29536 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMOD1P29536 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMOD1P29536 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LMOD1P29536 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LMOD1P29536 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMOD1P29536 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMOD1P29536 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LMOD1P29536 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.4 ms