Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GJB2P29033 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJB2P29033 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJB2P29033 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJB2P29033 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJB2P29033 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GJB2P29033 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJB2P29033 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJB2P29033 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJB2P29033 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJB2P29033 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GJB2P29033 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJB2P29033 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJB2P29033 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJB2P29033 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJB2P29033 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJB2P29033 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJB2P29033 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJB2P29033 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJB2P29033 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJB2P29033 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJB2P29033 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
GJB2P29033 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJB2P29033 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJB2P29033 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJB2P29033 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJB2P29033 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJB2P29033 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJB2P29033 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJB2P29033 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJB2P29033 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJB2P29033 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJB2P29033 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJB2P29033 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB2P29033 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB2P29033 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GJB2P29033 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GJB2P29033 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GJB2P29033 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJB2P29033 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GJB2P29033 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GJB2P29033 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GJB2P29033 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJB2P29033 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJB2P29033 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJB2P29033 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJB2P29033 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJB2P29033 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJB2P29033 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJB2P29033 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJB2P29033 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJB2P29033 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJB2P29033 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJB2P29033 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GJB2P29033 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
GJB2P29033 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GJB2P29033 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
GJB2P29033 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJB2P29033 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GJB2P29033 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJB2P29033 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJB2P29033 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GJB2P29033 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GJB2P29033 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJB2P29033 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJB2P29033 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJB2P29033 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJB2P29033 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJB2P29033 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJB2P29033 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJB2P29033 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJB2P29033 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GJB2P29033 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GJB2P29033 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GJB2P29033 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GJB2P29033 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJB2P29033 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJB2P29033 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GJB2P29033 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJB2P29033 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJB2P29033 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJB2P29033 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJB2P29033 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJB2P29033 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJB2P29033 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GJB2P29033 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJB2P29033 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJB2P29033 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJB2P29033 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJB2P29033 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
GJB2P29033 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
GJB2P29033 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GJB2P29033 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GJB2P29033 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GJB2P29033 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GJB2P29033 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GJB2P29033 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GJB2P29033 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GJB2P29033 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJB2P29033 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms