Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DUSP1P28562 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DUSP1P28562 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUSP1P28562 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP1P28562 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms