Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRB3P28472 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRB3P28472 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRB3P28472 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABRB3P28472 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms