Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HMGB2P26583 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HMGB2P26583 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HMGB2P26583 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HMGB2P26583 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HMGB2P26583 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HMGB2P26583 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HMGB2P26583 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HMGB2P26583 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HMGB2P26583 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HMGB2P26583 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HMGB2P26583 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HMGB2P26583 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HMGB2P26583 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HMGB2P26583 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HMGB2P26583 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HMGB2P26583 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HMGB2P26583 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HMGB2P26583 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HMGB2P26583 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HMGB2P26583 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HMGB2P26583 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HMGB2P26583 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HMGB2P26583 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HMGB2P26583 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HMGB2P26583 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HMGB2P26583 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HMGB2P26583 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HMGB2P26583 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HMGB2P26583 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGB2P26583 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HMGB2P26583 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
HMGB2P26583 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HMGB2P26583 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGB2P26583 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HMGB2P26583 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HMGB2P26583 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
HMGB2P26583 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HMGB2P26583 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGB2P26583 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGB2P26583 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
HMGB2P26583 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HMGB2P26583 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGB2P26583 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HMGB2P26583 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HMGB2P26583 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
HMGB2P26583 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HMGB2P26583 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HMGB2P26583 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HMGB2P26583 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HMGB2P26583 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HMGB2P26583 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HMGB2P26583 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
HMGB2P26583 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
HMGB2P26583 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
HMGB2P26583 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
HMGB2P26583 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
HMGB2P26583 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
HMGB2P26583 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
HMGB2P26583 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HMGB2P26583 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms