Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIAP25963 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKBIAP25963 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIAP25963 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIAP25963 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIAP25963 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKBIAP25963 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKBIAP25963 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFKBIAP25963 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NFKBIAP25963 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIAP25963 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKBIAP25963 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKBIAP25963 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKBIAP25963 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFKBIAP25963 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIAP25963 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms