Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP5A1P25705 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5A1P25705 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5A1P25705 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP5A1P25705 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5A1P25705 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5A1P25705 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms