Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EIF4BP23588 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4BP23588 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4BP23588 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EIF4BP23588 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EIF4BP23588 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EIF4BP23588 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EIF4BP23588 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EIF4BP23588 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EIF4BP23588 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF4BP23588 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF4BP23588 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EIF4BP23588 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EIF4BP23588 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EIF4BP23588 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EIF4BP23588 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EIF4BP23588 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EIF4BP23588 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EIF4BP23588 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EIF4BP23588 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EIF4BP23588 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EIF4BP23588 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EIF4BP23588 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EIF4BP23588 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EIF4BP23588 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
EIF4BP23588 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EIF4BP23588 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EIF4BP23588 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EIF4BP23588 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EIF4BP23588 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EIF4BP23588 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EIF4BP23588 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EIF4BP23588 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EIF4BP23588 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EIF4BP23588 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EIF4BP23588 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EIF4BP23588 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EIF4BP23588 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EIF4BP23588 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EIF4BP23588 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EIF4BP23588 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EIF4BP23588 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EIF4BP23588 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EIF4BP23588 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EIF4BP23588 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EIF4BP23588 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EIF4BP23588 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EIF4BP23588 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EIF4BP23588 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF4BP23588 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF4BP23588 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF4BP23588 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EIF4BP23588 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF4BP23588 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF4BP23588 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF4BP23588 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EIF4BP23588 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF4BP23588 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EIF4BP23588 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EIF4BP23588 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF4BP23588 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EIF4BP23588 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF4BP23588 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EIF4BP23588 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF4BP23588 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF4BP23588 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EIF4BP23588 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF4BP23588 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EIF4BP23588 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms