Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYF6P23409 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYF6P23409 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYF6P23409 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYF6P23409 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYF6P23409 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYF6P23409 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYF6P23409 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYF6P23409 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYF6P23409 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYF6P23409 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYF6P23409 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYF6P23409 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYF6P23409 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYF6P23409 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYF6P23409 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYF6P23409 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYF6P23409 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYF6P23409 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYF6P23409 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYF6P23409 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYF6P23409 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYF6P23409 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYF6P23409 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYF6P23409 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYF6P23409 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYF6P23409 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYF6P23409 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYF6P23409 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYF6P23409 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYF6P23409 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYF6P23409 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYF6P23409 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYF6P23409 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYF6P23409 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYF6P23409 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYF6P23409 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYF6P23409 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYF6P23409 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYF6P23409 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYF6P23409 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYF6P23409 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYF6P23409 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYF6P23409 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYF6P23409 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYF6P23409 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYF6P23409 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYF6P23409 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYF6P23409 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYF6P23409 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYF6P23409 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYF6P23409 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYF6P23409 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYF6P23409 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYF6P23409 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYF6P23409 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYF6P23409 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYF6P23409 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYF6P23409 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYF6P23409 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYF6P23409 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYF6P23409 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYF6P23409 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYF6P23409 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYF6P23409 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYF6P23409 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYF6P23409 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYF6P23409 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYF6P23409 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYF6P23409 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYF6P23409 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYF6P23409 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYF6P23409 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYF6P23409 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYF6P23409 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYF6P23409 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYF6P23409 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYF6P23409 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYF6P23409 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYF6P23409 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYF6P23409 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYF6P23409 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYF6P23409 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYF6P23409 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MYF6P23409 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYF6P23409 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYF6P23409 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYF6P23409 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYF6P23409 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYF6P23409 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYF6P23409 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYF6P23409 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYF6P23409 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYF6P23409 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYF6P23409 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYF6P23409 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYF6P23409 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYF6P23409 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYF6P23409 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MYF6P23409 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms