Protein–RNA interactions for Protein: P22674

CCNO, Cyclin-O, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNOP22674 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNOP22674 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNOP22674 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNOP22674 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNOP22674 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNOP22674 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNOP22674 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNOP22674 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNOP22674 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNOP22674 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNOP22674 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNOP22674 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNOP22674 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNOP22674 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNOP22674 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNOP22674 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNOP22674 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNOP22674 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNOP22674 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNOP22674 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNOP22674 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNOP22674 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNOP22674 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNOP22674 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNOP22674 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNOP22674 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNOP22674 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNOP22674 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNOP22674 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNOP22674 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNOP22674 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNOP22674 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNOP22674 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNOP22674 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNOP22674 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNOP22674 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNOP22674 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNOP22674 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNOP22674 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNOP22674 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNOP22674 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNOP22674 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNOP22674 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNOP22674 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNOP22674 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNOP22674 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNOP22674 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNOP22674 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNOP22674 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNOP22674 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNOP22674 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNOP22674 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNOP22674 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNOP22674 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNOP22674 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNOP22674 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNOP22674 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNOP22674 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNOP22674 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNOP22674 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNOP22674 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNOP22674 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNOP22674 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNOP22674 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNOP22674 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNOP22674 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNOP22674 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNOP22674 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNOP22674 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNOP22674 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNOP22674 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNOP22674 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNOP22674 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNOP22674 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNOP22674 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNOP22674 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNOP22674 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNOP22674 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNOP22674 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNOP22674 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNOP22674 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNOP22674 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNOP22674 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNOP22674 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNOP22674 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNOP22674 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNOP22674 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNOP22674 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNOP22674 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNOP22674 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNOP22674 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNOP22674 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNOP22674 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNOP22674 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNOP22674 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNOP22674 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNOP22674 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNOP22674 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNOP22674 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNOP22674 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms