Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGFR3P22607 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGFR3P22607 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR3P22607 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR3P22607 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR3P22607 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR3P22607 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR3P22607 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGFR3P22607 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGFR3P22607 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGFR3P22607 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FGFR3P22607 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGFR3P22607 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGFR3P22607 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGFR3P22607 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGFR3P22607 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGFR3P22607 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGFR3P22607 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGFR3P22607 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGFR3P22607 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGFR3P22607 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FGFR3P22607 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGFR3P22607 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGFR3P22607 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGFR3P22607 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FGFR3P22607 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGFR3P22607 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGFR3P22607 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FGFR3P22607 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGFR3P22607 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FGFR3P22607 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FGFR3P22607 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGFR3P22607 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FGFR3P22607 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FGFR3P22607 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FGFR3P22607 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGFR3P22607 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR3P22607 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR3P22607 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR3P22607 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR3P22607 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR3P22607 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR3P22607 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR3P22607 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR3P22607 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR3P22607 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR3P22607 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR3P22607 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR3P22607 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR3P22607 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR3P22607 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR3P22607 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGFR3P22607 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
FGFR3P22607 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGFR3P22607 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms