Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MATN1P21941 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MATN1P21941 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MATN1P21941 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MATN1P21941 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MATN1P21941 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN1P21941 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN1P21941 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN1P21941 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN1P21941 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MATN1P21941 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN1P21941 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN1P21941 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN1P21941 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN1P21941 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN1P21941 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN1P21941 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MATN1P21941 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN1P21941 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN1P21941 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MATN1P21941 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MATN1P21941 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MATN1P21941 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MATN1P21941 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MATN1P21941 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MATN1P21941 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MATN1P21941 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MATN1P21941 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MATN1P21941 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MATN1P21941 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MATN1P21941 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MATN1P21941 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MATN1P21941 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MATN1P21941 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MATN1P21941 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MATN1P21941 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MATN1P21941 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MATN1P21941 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN1P21941 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN1P21941 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN1P21941 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN1P21941 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN1P21941 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MATN1P21941 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MATN1P21941 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MATN1P21941 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MATN1P21941 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MATN1P21941 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MATN1P21941 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MATN1P21941 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MATN1P21941 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MATN1P21941 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MATN1P21941 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MATN1P21941 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MATN1P21941 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MATN1P21941 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MATN1P21941 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MATN1P21941 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MATN1P21941 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MATN1P21941 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MATN1P21941 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MATN1P21941 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MATN1P21941 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MATN1P21941 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MATN1P21941 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MATN1P21941 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MATN1P21941 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MATN1P21941 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MATN1P21941 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MATN1P21941 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MATN1P21941 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MATN1P21941 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MATN1P21941 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MATN1P21941 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MATN1P21941 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MATN1P21941 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MATN1P21941 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MATN1P21941 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN1P21941 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN1P21941 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN1P21941 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MATN1P21941 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MATN1P21941 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MATN1P21941 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN1P21941 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN1P21941 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN1P21941 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN1P21941 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN1P21941 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MATN1P21941 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MATN1P21941 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MATN1P21941 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MATN1P21941 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MATN1P21941 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MATN1P21941 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN1P21941 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN1P21941 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN1P21941 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MATN1P21941 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MATN1P21941 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms