Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ATF3P18847 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ATF3P18847 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ATF3P18847 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ATF3P18847 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ATF3P18847 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ATF3P18847 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ATF3P18847 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
ATF3P18847 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ATF3P18847 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
ATF3P18847 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ATF3P18847 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ATF3P18847 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ATF3P18847 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ATF3P18847 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
ATF3P18847 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ATF3P18847 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ATF3P18847 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ATF3P18847 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ATF3P18847 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ATF3P18847 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
ATF3P18847 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ATF3P18847 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ATF3P18847 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ATF3P18847 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ATF3P18847 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ATF3P18847 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ATF3P18847 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ATF3P18847 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ATF3P18847 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ATF3P18847 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ATF3P18847 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ATF3P18847 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ATF3P18847 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ATF3P18847 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ATF3P18847 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ATF3P18847 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ATF3P18847 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATF3P18847 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ATF3P18847 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ATF3P18847 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATF3P18847 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATF3P18847 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
ATF3P18847 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATF3P18847 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATF3P18847 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ATF3P18847 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ATF3P18847 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ATF3P18847 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
ATF3P18847 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ATF3P18847 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ATF3P18847 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ATF3P18847 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ATF3P18847 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ATF3P18847 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ATF3P18847 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ATF3P18847 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATF3P18847 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATF3P18847 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATF3P18847 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATF3P18847 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATF3P18847 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATF3P18847 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
ATF3P18847 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATF3P18847 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATF3P18847 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATF3P18847 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATF3P18847 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATF3P18847 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATF3P18847 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATF3P18847 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATF3P18847 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ATF3P18847 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ATF3P18847 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ATF3P18847 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ATF3P18847 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ATF3P18847 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATF3P18847 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
ATF3P18847 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATF3P18847 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATF3P18847 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATF3P18847 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ATF3P18847 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
ATF3P18847 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ATF3P18847 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ATF3P18847 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ATF3P18847 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
ATF3P18847 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
ATF3P18847 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ATF3P18847 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ATF3P18847 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ATF3P18847 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
ATF3P18847 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ATF3P18847 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ATF3P18847 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ATF3P18847 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ATF3P18847 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
ATF3P18847 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ATF3P18847 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ATF3P18847 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.2 ms