Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NELFEP18615 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFEP18615 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFEP18615 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NELFEP18615 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELFEP18615 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELFEP18615 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELFEP18615 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFEP18615 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFEP18615 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFEP18615 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFEP18615 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFEP18615 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFEP18615 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFEP18615 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFEP18615 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFEP18615 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFEP18615 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFEP18615 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFEP18615 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFEP18615 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFEP18615 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NELFEP18615 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NELFEP18615 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NELFEP18615 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELFEP18615 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELFEP18615 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFEP18615 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFEP18615 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFEP18615 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFEP18615 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFEP18615 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELFEP18615 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NELFEP18615 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELFEP18615 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELFEP18615 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELFEP18615 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFEP18615 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFEP18615 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFEP18615 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFEP18615 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFEP18615 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFEP18615 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFEP18615 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFEP18615 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFEP18615 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFEP18615 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NELFEP18615 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NELFEP18615 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NELFEP18615 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFEP18615 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFEP18615 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFEP18615 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NELFEP18615 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NELFEP18615 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELFEP18615 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NELFEP18615 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFEP18615 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFEP18615 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NELFEP18615 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NELFEP18615 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFEP18615 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFEP18615 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFEP18615 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NELFEP18615 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFEP18615 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFEP18615 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFEP18615 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NELFEP18615 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFEP18615 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFEP18615 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFEP18615 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFEP18615 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFEP18615 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NELFEP18615 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELFEP18615 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NELFEP18615 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFEP18615 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFEP18615 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFEP18615 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFEP18615 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFEP18615 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFEP18615 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NELFEP18615 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NELFEP18615 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFEP18615 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NELFEP18615 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NELFEP18615 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NELFEP18615 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFEP18615 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFEP18615 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFEP18615 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NELFEP18615 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFEP18615 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFEP18615 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NELFEP18615 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELFEP18615 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELFEP18615 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELFEP18615 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELFEP18615 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
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