Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB6P18564 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB6P18564 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB6P18564 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB6P18564 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB6P18564 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms