Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRAP18433 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRAP18433 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRAP18433 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRAP18433 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRAP18433 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRAP18433 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRAP18433 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRAP18433 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRAP18433 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRAP18433 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRAP18433 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRAP18433 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRAP18433 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRAP18433 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRAP18433 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRAP18433 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRAP18433 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRAP18433 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRAP18433 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRAP18433 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRAP18433 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRAP18433 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRAP18433 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRAP18433 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRAP18433 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRAP18433 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRAP18433 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRAP18433 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRAP18433 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRAP18433 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRAP18433 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRAP18433 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRAP18433 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRAP18433 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRAP18433 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRAP18433 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRAP18433 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRAP18433 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRAP18433 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRAP18433 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRAP18433 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRAP18433 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRAP18433 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRAP18433 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRAP18433 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRAP18433 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRAP18433 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRAP18433 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRAP18433 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms