Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCLP18206 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCLP18206 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCLP18206 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCLP18206 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCLP18206 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCLP18206 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCLP18206 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCLP18206 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCLP18206 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCLP18206 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCLP18206 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCLP18206 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCLP18206 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VCLP18206 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCLP18206 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCLP18206 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
VCLP18206 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCLP18206 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCLP18206 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCLP18206 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCLP18206 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCLP18206 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCLP18206 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCLP18206 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCLP18206 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCLP18206 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCLP18206 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCLP18206 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCLP18206 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCLP18206 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCLP18206 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCLP18206 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VCLP18206 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCLP18206 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCLP18206 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCLP18206 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCLP18206 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VCLP18206 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCLP18206 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
VCLP18206 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCLP18206 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCLP18206 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCLP18206 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCLP18206 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCLP18206 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VCLP18206 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCLP18206 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCLP18206 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCLP18206 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCLP18206 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VCLP18206 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VCLP18206 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VCLP18206 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCLP18206 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VCLP18206 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCLP18206 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VCLP18206 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCLP18206 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCLP18206 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCLP18206 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCLP18206 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCLP18206 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VCLP18206 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCLP18206 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCLP18206 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCLP18206 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCLP18206 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCLP18206 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCLP18206 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCLP18206 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCLP18206 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCLP18206 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCLP18206 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCLP18206 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCLP18206 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCLP18206 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCLP18206 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCLP18206 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCLP18206 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VCLP18206 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCLP18206 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCLP18206 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCLP18206 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCLP18206 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCLP18206 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCLP18206 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCLP18206 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCLP18206 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VCLP18206 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VCLP18206 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCLP18206 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCLP18206 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCLP18206 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCLP18206 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VCLP18206 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCLP18206 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCLP18206 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCLP18206 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VCLP18206 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms