Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSP16219 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSP16219 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSP16219 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACADSP16219 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACADSP16219 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACADSP16219 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACADSP16219 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACADSP16219 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACADSP16219 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACADSP16219 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACADSP16219 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACADSP16219 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACADSP16219 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACADSP16219 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACADSP16219 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACADSP16219 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACADSP16219 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACADSP16219 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACADSP16219 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACADSP16219 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACADSP16219 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSP16219 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSP16219 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSP16219 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSP16219 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSP16219 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACADSP16219 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACADSP16219 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACADSP16219 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACADSP16219 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACADSP16219 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACADSP16219 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACADSP16219 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACADSP16219 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACADSP16219 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACADSP16219 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACADSP16219 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSP16219 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSP16219 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSP16219 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADSP16219 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADSP16219 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADSP16219 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADSP16219 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADSP16219 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADSP16219 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADSP16219 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACADSP16219 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACADSP16219 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACADSP16219 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADSP16219 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADSP16219 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADSP16219 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSP16219 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSP16219 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSP16219 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSP16219 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSP16219 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADSP16219 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADSP16219 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADSP16219 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADSP16219 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACADSP16219 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACADSP16219 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACADSP16219 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACADSP16219 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACADSP16219 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACADSP16219 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACADSP16219 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACADSP16219 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADSP16219 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADSP16219 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADSP16219 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACADSP16219 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACADSP16219 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACADSP16219 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSP16219 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSP16219 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSP16219 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADSP16219 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADSP16219 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADSP16219 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADSP16219 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADSP16219 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADSP16219 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSP16219 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSP16219 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSP16219 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSP16219 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSP16219 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSP16219 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSP16219 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADSP16219 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADSP16219 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADSP16219 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACADSP16219 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACADSP16219 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACADSP16219 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACADSP16219 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms