Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NME1P15531 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NME1P15531 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NME1P15531 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NME1P15531 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME1P15531 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME1P15531 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME1P15531 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NME1P15531 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NME1P15531 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME1P15531 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME1P15531 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME1P15531 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME1P15531 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME1P15531 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME1P15531 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME1P15531 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME1P15531 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME1P15531 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME1P15531 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME1P15531 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME1P15531 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME1P15531 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NME1P15531 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME1P15531 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NME1P15531 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NME1P15531 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NME1P15531 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NME1P15531 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NME1P15531 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NME1P15531 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NME1P15531 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME1P15531 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME1P15531 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME1P15531 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME1P15531 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME1P15531 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME1P15531 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NME1P15531 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME1P15531 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME1P15531 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME1P15531 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME1P15531 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME1P15531 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME1P15531 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME1P15531 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME1P15531 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME1P15531 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME1P15531 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME1P15531 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME1P15531 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME1P15531 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME1P15531 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME1P15531 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME1P15531 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME1P15531 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME1P15531 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME1P15531 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME1P15531 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME1P15531 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME1P15531 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME1P15531 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME1P15531 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME1P15531 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME1P15531 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME1P15531 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME1P15531 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME1P15531 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NME1P15531 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME1P15531 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME1P15531 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NME1P15531 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME1P15531 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME1P15531 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME1P15531 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME1P15531 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME1P15531 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NME1P15531 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME1P15531 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME1P15531 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME1P15531 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME1P15531 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME1P15531 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME1P15531 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME1P15531 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME1P15531 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME1P15531 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME1P15531 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME1P15531 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME1P15531 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME1P15531 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME1P15531 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME1P15531 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME1P15531 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME1P15531 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME1P15531 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NME1P15531 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME1P15531 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME1P15531 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME1P15531 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms