Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYOD1P15172 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYOD1P15172 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYOD1P15172 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MYOD1P15172 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYOD1P15172 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYOD1P15172 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MYOD1P15172 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYOD1P15172 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYOD1P15172 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MYOD1P15172 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYOD1P15172 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYOD1P15172 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYOD1P15172 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYOD1P15172 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MYOD1P15172 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MYOD1P15172 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MYOD1P15172 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYOD1P15172 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms