Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFD2P13995 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD2P13995 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD2P13995 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD2P13995 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD2P13995 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD2P13995 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD2P13995 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD2P13995 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD2P13995 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD2P13995 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD2P13995 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTHFD2P13995 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTHFD2P13995 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTHFD2P13995 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms