Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP4P12644 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP4P12644 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP4P12644 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP4P12644 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP4P12644 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP4P12644 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP4P12644 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP4P12644 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP4P12644 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP4P12644 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP4P12644 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP4P12644 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMP4P12644 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP4P12644 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP4P12644 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMP4P12644 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP4P12644 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP4P12644 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMP4P12644 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP4P12644 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP4P12644 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMP4P12644 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP4P12644 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP4P12644 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP4P12644 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP4P12644 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMP4P12644 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP4P12644 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP4P12644 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP4P12644 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP4P12644 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP4P12644 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP4P12644 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP4P12644 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP4P12644 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BMP4P12644 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BMP4P12644 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP4P12644 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP4P12644 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP4P12644 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP4P12644 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP4P12644 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP4P12644 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP4P12644 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP4P12644 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP4P12644 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMP4P12644 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMP4P12644 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP4P12644 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP4P12644 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP4P12644 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMP4P12644 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BMP4P12644 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMP4P12644 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMP4P12644 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMP4P12644 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BMP4P12644 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP4P12644 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP4P12644 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP4P12644 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP4P12644 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BMP4P12644 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP4P12644 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP4P12644 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP4P12644 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMP4P12644 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP4P12644 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BMP4P12644 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BMP4P12644 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP4P12644 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP4P12644 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP4P12644 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP4P12644 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BMP4P12644 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP4P12644 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP4P12644 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMP4P12644 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP4P12644 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP4P12644 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP4P12644 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP4P12644 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BMP4P12644 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMP4P12644 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BMP4P12644 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP4P12644 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP4P12644 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP4P12644 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP4P12644 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP4P12644 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP4P12644 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BMP4P12644 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP4P12644 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP4P12644 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP4P12644 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP4P12644 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP4P12644 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP4P12644 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BMP4P12644 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP4P12644 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms