Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HARSP12081 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HARSP12081 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HARSP12081 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HARSP12081 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HARSP12081 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HARSP12081 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HARSP12081 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HARSP12081 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HARSP12081 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HARSP12081 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HARSP12081 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HARSP12081 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HARSP12081 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HARSP12081 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HARSP12081 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HARSP12081 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HARSP12081 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HARSP12081 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HARSP12081 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HARSP12081 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HARSP12081 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HARSP12081 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HARSP12081 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HARSP12081 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HARSP12081 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HARSP12081 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HARSP12081 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HARSP12081 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HARSP12081 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HARSP12081 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HARSP12081 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HARSP12081 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HARSP12081 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HARSP12081 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HARSP12081 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HARSP12081 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HARSP12081 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HARSP12081 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HARSP12081 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HARSP12081 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HARSP12081 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HARSP12081 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HARSP12081 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HARSP12081 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HARSP12081 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HARSP12081 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HARSP12081 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HARSP12081 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HARSP12081 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HARSP12081 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HARSP12081 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HARSP12081 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HARSP12081 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HARSP12081 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HARSP12081 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HARSP12081 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HARSP12081 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HARSP12081 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HARSP12081 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HARSP12081 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HARSP12081 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HARSP12081 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HARSP12081 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HARSP12081 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HARSP12081 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HARSP12081 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HARSP12081 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HARSP12081 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HARSP12081 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HARSP12081 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HARSP12081 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HARSP12081 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HARSP12081 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HARSP12081 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HARSP12081 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HARSP12081 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HARSP12081 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HARSP12081 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HARSP12081 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HARSP12081 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HARSP12081 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HARSP12081 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HARSP12081 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HARSP12081 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HARSP12081 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HARSP12081 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HARSP12081 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HARSP12081 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HARSP12081 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HARSP12081 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HARSP12081 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HARSP12081 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HARSP12081 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HARSP12081 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HARSP12081 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HARSP12081 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HARSP12081 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HARSP12081 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HARSP12081 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms