Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFHP12036 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEFHP12036 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFHP12036 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFHP12036 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEFHP12036 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFHP12036 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFHP12036 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFHP12036 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFHP12036 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFHP12036 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFHP12036 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFHP12036 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFHP12036 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFHP12036 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFHP12036 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFHP12036 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFHP12036 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFHP12036 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFHP12036 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFHP12036 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEFHP12036 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEFHP12036 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFHP12036 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFHP12036 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFHP12036 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFHP12036 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFHP12036 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFHP12036 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFHP12036 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFHP12036 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFHP12036 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFHP12036 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFHP12036 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFHP12036 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFHP12036 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFHP12036 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFHP12036 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFHP12036 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFHP12036 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFHP12036 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFHP12036 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFHP12036 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFHP12036 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFHP12036 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFHP12036 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFHP12036 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFHP12036 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFHP12036 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFHP12036 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFHP12036 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFHP12036 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFHP12036 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEFHP12036 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFHP12036 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFHP12036 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFHP12036 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEFHP12036 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFHP12036 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFHP12036 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFHP12036 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFHP12036 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEFHP12036 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFHP12036 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFHP12036 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFHP12036 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEFHP12036 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFHP12036 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFHP12036 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFHP12036 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFHP12036 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFHP12036 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFHP12036 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFHP12036 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NEFHP12036 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFHP12036 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFHP12036 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFHP12036 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFHP12036 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFHP12036 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFHP12036 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFHP12036 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFHP12036 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFHP12036 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFHP12036 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFHP12036 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFHP12036 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFHP12036 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFHP12036 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFHP12036 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFHP12036 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEFHP12036 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEFHP12036 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFHP12036 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFHP12036 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEFHP12036 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFHP12036 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFHP12036 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFHP12036 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEFHP12036 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms