Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMIGD3P0DMS9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMIGD3P0DMS9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD3P0DMS9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms