Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RD3LP0DJH9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RD3LP0DJH9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RD3LP0DJH9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RD3LP0DJH9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms