Protein–RNA interactions for Protein: P0C8F1

PATE4, Prostate and testis expressed protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE4P0C8F1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PATE4P0C8F1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATE4P0C8F1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATE4P0C8F1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATE4P0C8F1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATE4P0C8F1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATE4P0C8F1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATE4P0C8F1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATE4P0C8F1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATE4P0C8F1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PATE4P0C8F1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PATE4P0C8F1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATE4P0C8F1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms