Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTXN2P0C2S0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTXN2P0C2S0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTXN2P0C2S0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN2P0C2S0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN2P0C2S0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms