Protein–RNA interactions for Protein: P0C2L3

FAM163B, Protein FAM163B, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM163BP0C2L3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM163BP0C2L3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM163BP0C2L3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM163BP0C2L3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM163BP0C2L3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM163BP0C2L3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM163BP0C2L3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM163BP0C2L3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM163BP0C2L3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM163BP0C2L3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM163BP0C2L3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM163BP0C2L3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM163BP0C2L3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM163BP0C2L3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM163BP0C2L3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM163BP0C2L3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM163BP0C2L3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM163BP0C2L3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM163BP0C2L3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM163BP0C2L3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM163BP0C2L3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM163BP0C2L3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM163BP0C2L3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FAM163BP0C2L3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM163BP0C2L3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM163BP0C2L3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM163BP0C2L3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM163BP0C2L3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM163BP0C2L3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM163BP0C2L3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM163BP0C2L3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM163BP0C2L3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM163BP0C2L3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM163BP0C2L3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM163BP0C2L3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms