Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLTAP09496 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTAP09496 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTAP09496 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTAP09496 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLTAP09496 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTAP09496 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLTAP09496 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTAP09496 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLTAP09496 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTAP09496 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTAP09496 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTAP09496 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTAP09496 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLTAP09496 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLTAP09496 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLTAP09496 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTAP09496 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTAP09496 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTAP09496 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLTAP09496 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTAP09496 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTAP09496 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTAP09496 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTAP09496 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLTAP09496 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLTAP09496 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLTAP09496 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLTAP09496 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLTAP09496 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLTAP09496 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLTAP09496 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTAP09496 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLTAP09496 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLTAP09496 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLTAP09496 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CLTAP09496 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLTAP09496 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLTAP09496 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLTAP09496 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLTAP09496 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLTAP09496 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLTAP09496 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLTAP09496 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLTAP09496 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLTAP09496 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLTAP09496 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLTAP09496 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLTAP09496 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTAP09496 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTAP09496 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTAP09496 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLTAP09496 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTAP09496 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTAP09496 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTAP09496 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTAP09496 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTAP09496 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTAP09496 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLTAP09496 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLTAP09496 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLTAP09496 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLTAP09496 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLTAP09496 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLTAP09496 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLTAP09496 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLTAP09496 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLTAP09496 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLTAP09496 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLTAP09496 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTAP09496 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTAP09496 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTAP09496 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTAP09496 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTAP09496 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTAP09496 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLTAP09496 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTAP09496 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTAP09496 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLTAP09496 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLTAP09496 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLTAP09496 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTAP09496 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTAP09496 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTAP09496 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLTAP09496 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTAP09496 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTAP09496 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTAP09496 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLTAP09496 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLTAP09496 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLTAP09496 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLTAP09496 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLTAP09496 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLTAP09496 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTAP09496 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTAP09496 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTAP09496 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTAP09496 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLTAP09496 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms