Protein–RNA interactions for Protein: P08603

CFH, Complement factor H, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHP08603 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFHP08603 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFHP08603 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CFHP08603 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFHP08603 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFHP08603 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFHP08603 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFHP08603 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFHP08603 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CFHP08603 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFHP08603 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFHP08603 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFHP08603 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFHP08603 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFHP08603 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CFHP08603 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFHP08603 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFHP08603 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFHP08603 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFHP08603 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFHP08603 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFHP08603 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFHP08603 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFHP08603 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFHP08603 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFHP08603 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFHP08603 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFHP08603 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CFHP08603 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CFHP08603 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFHP08603 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFHP08603 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFHP08603 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFHP08603 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFHP08603 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFHP08603 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFHP08603 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFHP08603 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFHP08603 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFHP08603 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CFHP08603 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFHP08603 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFHP08603 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFHP08603 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFHP08603 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFHP08603 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFHP08603 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFHP08603 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFHP08603 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFHP08603 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFHP08603 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFHP08603 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFHP08603 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFHP08603 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CFHP08603 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFHP08603 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFHP08603 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CFHP08603 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFHP08603 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFHP08603 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFHP08603 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFHP08603 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFHP08603 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFHP08603 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFHP08603 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFHP08603 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFHP08603 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFHP08603 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFHP08603 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFHP08603 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFHP08603 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFHP08603 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFHP08603 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFHP08603 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFHP08603 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CFHP08603 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CFHP08603 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CFHP08603 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CFHP08603 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFHP08603 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFHP08603 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFHP08603 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFHP08603 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFHP08603 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFHP08603 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFHP08603 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFHP08603 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFHP08603 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFHP08603 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFHP08603 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFHP08603 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFHP08603 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFHP08603 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CFHP08603 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFHP08603 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFHP08603 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFHP08603 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFHP08603 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CFHP08603 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFHP08603 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms