Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MGPP08493 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MGPP08493 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MGPP08493 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MGPP08493 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MGPP08493 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MGPP08493 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MGPP08493 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MGPP08493 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MGPP08493 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MGPP08493 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MGPP08493 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MGPP08493 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MGPP08493 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MGPP08493 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MGPP08493 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MGPP08493 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MGPP08493 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MGPP08493 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MGPP08493 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MGPP08493 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MGPP08493 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MGPP08493 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MGPP08493 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MGPP08493 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MGPP08493 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MGPP08493 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MGPP08493 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MGPP08493 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MGPP08493 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MGPP08493 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MGPP08493 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MGPP08493 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MGPP08493 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MGPP08493 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MGPP08493 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MGPP08493 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MGPP08493 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MGPP08493 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MGPP08493 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MGPP08493 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MGPP08493 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MGPP08493 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MGPP08493 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MGPP08493 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MGPP08493 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MGPP08493 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MGPP08493 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MGPP08493 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MGPP08493 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MGPP08493 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MGPP08493 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MGPP08493 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MGPP08493 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MGPP08493 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MGPP08493 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MGPP08493 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MGPP08493 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MGPP08493 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MGPP08493 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MGPP08493 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MGPP08493 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MGPP08493 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MGPP08493 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MGPP08493 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MGPP08493 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MGPP08493 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MGPP08493 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MGPP08493 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MGPP08493 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MGPP08493 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MGPP08493 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MGPP08493 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MGPP08493 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MGPP08493 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MGPP08493 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MGPP08493 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MGPP08493 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MGPP08493 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MGPP08493 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MGPP08493 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MGPP08493 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MGPP08493 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MGPP08493 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MGPP08493 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MGPP08493 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MGPP08493 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MGPP08493 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MGPP08493 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MGPP08493 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MGPP08493 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MGPP08493 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MGPP08493 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MGPP08493 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MGPP08493 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MGPP08493 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MGPP08493 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MGPP08493 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MGPP08493 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MGPP08493 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms