Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHOP08100 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHOP08100 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOP08100 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOP08100 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOP08100 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOP08100 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RHOP08100 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHOP08100 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHOP08100 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHOP08100 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RHOP08100 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RHOP08100 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RHOP08100 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RHOP08100 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RHOP08100 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOP08100 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOP08100 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOP08100 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOP08100 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOP08100 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOP08100 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOP08100 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOP08100 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOP08100 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOP08100 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOP08100 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RHOP08100 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RHOP08100 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RHOP08100 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RHOP08100 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RHOP08100 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RHOP08100 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RHOP08100 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RHOP08100 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RHOP08100 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RHOP08100 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RHOP08100 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RHOP08100 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHOP08100 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHOP08100 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHOP08100 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHOP08100 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOP08100 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOP08100 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RHOP08100 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RHOP08100 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOP08100 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOP08100 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOP08100 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOP08100 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHOP08100 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RHOP08100 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOP08100 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOP08100 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOP08100 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOP08100 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOP08100 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOP08100 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHOP08100 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHOP08100 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHOP08100 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RHOP08100 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RHOP08100 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RHOP08100 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHOP08100 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHOP08100 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOP08100 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOP08100 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOP08100 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOP08100 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOP08100 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOP08100 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHOP08100 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHOP08100 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHOP08100 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOP08100 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOP08100 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOP08100 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOP08100 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RHOP08100 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOP08100 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOP08100 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOP08100 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOP08100 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOP08100 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOP08100 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOP08100 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOP08100 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOP08100 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOP08100 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOP08100 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOP08100 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHOP08100 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RHOP08100 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOP08100 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOP08100 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOP08100 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOP08100 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOP08100 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms