Protein–RNA interactions for Protein: P07766

CD3E, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EP07766 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD3EP07766 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD3EP07766 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD3EP07766 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD3EP07766 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD3EP07766 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD3EP07766 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD3EP07766 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD3EP07766 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD3EP07766 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD3EP07766 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD3EP07766 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD3EP07766 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD3EP07766 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD3EP07766 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD3EP07766 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD3EP07766 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD3EP07766 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD3EP07766 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD3EP07766 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD3EP07766 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD3EP07766 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EP07766 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EP07766 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EP07766 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EP07766 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EP07766 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD3EP07766 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD3EP07766 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EP07766 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EP07766 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EP07766 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EP07766 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD3EP07766 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD3EP07766 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD3EP07766 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD3EP07766 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD3EP07766 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD3EP07766 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD3EP07766 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD3EP07766 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD3EP07766 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD3EP07766 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD3EP07766 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD3EP07766 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD3EP07766 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD3EP07766 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD3EP07766 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD3EP07766 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD3EP07766 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CD3EP07766 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CD3EP07766 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD3EP07766 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD3EP07766 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD3EP07766 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD3EP07766 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD3EP07766 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD3EP07766 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD3EP07766 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD3EP07766 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD3EP07766 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD3EP07766 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD3EP07766 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD3EP07766 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD3EP07766 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD3EP07766 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3EP07766 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3EP07766 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3EP07766 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3EP07766 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3EP07766 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3EP07766 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3EP07766 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3EP07766 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3EP07766 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3EP07766 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3EP07766 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3EP07766 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD3EP07766 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD3EP07766 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD3EP07766 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD3EP07766 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD3EP07766 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD3EP07766 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD3EP07766 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD3EP07766 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD3EP07766 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD3EP07766 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD3EP07766 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD3EP07766 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD3EP07766 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CD3EP07766 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD3EP07766 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD3EP07766 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD3EP07766 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD3EP07766 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD3EP07766 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD3EP07766 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD3EP07766 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD3EP07766 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms