Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGRP06401 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGRP06401 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGRP06401 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGRP06401 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGRP06401 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGRP06401 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGRP06401 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGRP06401 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGRP06401 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGRP06401 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGRP06401 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGRP06401 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGRP06401 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PGRP06401 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGRP06401 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGRP06401 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGRP06401 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGRP06401 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PGRP06401 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGRP06401 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGRP06401 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGRP06401 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGRP06401 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGRP06401 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGRP06401 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PGRP06401 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGRP06401 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGRP06401 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGRP06401 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PGRP06401 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGRP06401 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGRP06401 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGRP06401 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGRP06401 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGRP06401 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGRP06401 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGRP06401 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGRP06401 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGRP06401 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGRP06401 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGRP06401 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGRP06401 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGRP06401 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGRP06401 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PGRP06401 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGRP06401 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGRP06401 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGRP06401 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGRP06401 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGRP06401 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGRP06401 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGRP06401 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGRP06401 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGRP06401 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGRP06401 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PGRP06401 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGRP06401 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGRP06401 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGRP06401 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGRP06401 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PGRP06401 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGRP06401 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGRP06401 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGRP06401 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGRP06401 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGRP06401 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGRP06401 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGRP06401 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGRP06401 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGRP06401 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGRP06401 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGRP06401 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGRP06401 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGRP06401 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGRP06401 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PGRP06401 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGRP06401 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGRP06401 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGRP06401 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PGRP06401 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGRP06401 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGRP06401 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGRP06401 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGRP06401 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGRP06401 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGRP06401 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGRP06401 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGRP06401 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGRP06401 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGRP06401 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGRP06401 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGRP06401 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGRP06401 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGRP06401 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGRP06401 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGRP06401 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGRP06401 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGRP06401 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGRP06401 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms