Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGB1P05556 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB1P05556 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB1P05556 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGB1P05556 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGB1P05556 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGB1P05556 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB1P05556 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB1P05556 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB1P05556 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB1P05556 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB1P05556 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB1P05556 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms