Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SERPIND1P05546 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SERPIND1P05546 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPIND1P05546 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPIND1P05546 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPIND1P05546 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPIND1P05546 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SERPIND1P05546 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERPIND1P05546 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERPIND1P05546 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERPIND1P05546 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERPIND1P05546 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERPIND1P05546 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERPIND1P05546 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPIND1P05546 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SERPIND1P05546 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPIND1P05546 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms