Protein–RNA interactions for Protein: P03891

MT-ND2, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND2P03891 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MT-ND2P03891 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MT-ND2P03891 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MT-ND2P03891 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MT-ND2P03891 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MT-ND2P03891 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms