Protein–RNA interactions for Protein: P02766

TTR, Transthyretin, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTRP02766 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTRP02766 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTRP02766 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTRP02766 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTRP02766 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTRP02766 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTRP02766 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTRP02766 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTRP02766 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTRP02766 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTRP02766 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTRP02766 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTRP02766 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTRP02766 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTRP02766 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTRP02766 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTRP02766 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
TTRP02766 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTRP02766 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTRP02766 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTRP02766 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTRP02766 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTRP02766 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTRP02766 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTRP02766 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTRP02766 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTRP02766 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTRP02766 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTRP02766 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTRP02766 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTRP02766 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTRP02766 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTRP02766 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTRP02766 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTRP02766 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTRP02766 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTRP02766 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTRP02766 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTRP02766 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTRP02766 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTRP02766 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTRP02766 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTRP02766 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTRP02766 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTRP02766 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTRP02766 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTRP02766 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTRP02766 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTRP02766 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTRP02766 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTRP02766 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTRP02766 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTRP02766 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTRP02766 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTRP02766 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTRP02766 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTRP02766 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTRP02766 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTRP02766 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTRP02766 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTRP02766 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTRP02766 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTRP02766 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTRP02766 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTRP02766 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTRP02766 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTRP02766 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTRP02766 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTRP02766 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTRP02766 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTRP02766 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTRP02766 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTRP02766 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTRP02766 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTRP02766 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTRP02766 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTRP02766 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTRP02766 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTRP02766 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTRP02766 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTRP02766 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTRP02766 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTRP02766 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTRP02766 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTRP02766 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTRP02766 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTRP02766 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTRP02766 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTRP02766 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTRP02766 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTRP02766 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTRP02766 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTRP02766 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTRP02766 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTRP02766 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTRP02766 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTRP02766 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTRP02766 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTRP02766 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTRP02766 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms