Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
APOEP02649 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APOEP02649 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOEP02649 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOEP02649 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOEP02649 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOEP02649 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOEP02649 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOEP02649 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOEP02649 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOEP02649 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOEP02649 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
APOEP02649 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOEP02649 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOEP02649 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOEP02649 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOEP02649 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOEP02649 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOEP02649 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOEP02649 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOEP02649 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOEP02649 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOEP02649 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOEP02649 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOEP02649 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOEP02649 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOEP02649 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOEP02649 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOEP02649 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOEP02649 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOEP02649 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOEP02649 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOEP02649 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
APOEP02649 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOEP02649 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOEP02649 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOEP02649 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOEP02649 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOEP02649 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOEP02649 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOEP02649 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOEP02649 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOEP02649 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOEP02649 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOEP02649 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOEP02649 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOEP02649 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOEP02649 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOEP02649 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27■■□□□ 1.91
APOEP02649 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APOEP02649 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
APOEP02649 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOEP02649 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
APOEP02649 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOEP02649 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOEP02649 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOEP02649 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOEP02649 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOEP02649 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOEP02649 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOEP02649 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOEP02649 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOEP02649 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOEP02649 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOEP02649 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOEP02649 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOEP02649 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOEP02649 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOEP02649 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOEP02649 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOEP02649 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOEP02649 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOEP02649 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOEP02649 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOEP02649 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOEP02649 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOEP02649 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOEP02649 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
APOEP02649 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOEP02649 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
APOEP02649 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOEP02649 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOEP02649 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOEP02649 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOEP02649 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOEP02649 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOEP02649 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOEP02649 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOEP02649 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOEP02649 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOEP02649 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APOEP02649 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOEP02649 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOEP02649 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOEP02649 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOEP02649 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOEP02649 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOEP02649 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOEP02649 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOEP02649 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms