Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CD4P01730 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CD4P01730 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD4P01730 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD4P01730 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD4P01730 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CD4P01730 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CD4P01730 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CD4P01730 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CD4P01730 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CD4P01730 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CD4P01730 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CD4P01730 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD4P01730 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD4P01730 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CD4P01730 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD4P01730 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD4P01730 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD4P01730 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CD4P01730 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD4P01730 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD4P01730 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CD4P01730 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CD4P01730 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CD4P01730 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CD4P01730 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CD4P01730 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CD4P01730 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CD4P01730 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CD4P01730 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CD4P01730 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CD4P01730 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CD4P01730 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CD4P01730 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CD4P01730 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CD4P01730 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD4P01730 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CD4P01730 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD4P01730 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD4P01730 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD4P01730 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD4P01730 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD4P01730 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD4P01730 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD4P01730 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD4P01730 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CD4P01730 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD4P01730 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD4P01730 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD4P01730 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD4P01730 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD4P01730 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD4P01730 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CD4P01730 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD4P01730 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD4P01730 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD4P01730 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CD4P01730 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD4P01730 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD4P01730 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD4P01730 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD4P01730 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD4P01730 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD4P01730 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD4P01730 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD4P01730 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CD4P01730 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD4P01730 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD4P01730 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD4P01730 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD4P01730 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD4P01730 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD4P01730 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD4P01730 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD4P01730 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD4P01730 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD4P01730 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CD4P01730 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD4P01730 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD4P01730 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD4P01730 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CD4P01730 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD4P01730 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CD4P01730 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD4P01730 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD4P01730 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD4P01730 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD4P01730 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD4P01730 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD4P01730 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD4P01730 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD4P01730 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD4P01730 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD4P01730 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD4P01730 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD4P01730 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD4P01730 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD4P01730 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD4P01730 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD4P01730 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms