Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRUB2O95900 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRUB2O95900 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRUB2O95900 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRUB2O95900 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRUB2O95900 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRUB2O95900 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRUB2O95900 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRUB2O95900 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRUB2O95900 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRUB2O95900 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRUB2O95900 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRUB2O95900 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRUB2O95900 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRUB2O95900 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRUB2O95900 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRUB2O95900 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRUB2O95900 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRUB2O95900 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRUB2O95900 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRUB2O95900 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRUB2O95900 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRUB2O95900 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRUB2O95900 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRUB2O95900 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRUB2O95900 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRUB2O95900 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRUB2O95900 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRUB2O95900 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRUB2O95900 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRUB2O95900 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRUB2O95900 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRUB2O95900 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRUB2O95900 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms