Protein–RNA interactions for Protein: O95858

TSPAN15, Tetraspanin-15, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN15O95858 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN15O95858 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSPAN15O95858 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN15O95858 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN15O95858 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN15O95858 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN15O95858 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN15O95858 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN15O95858 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN15O95858 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN15O95858 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN15O95858 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN15O95858 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN15O95858 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN15O95858 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN15O95858 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN15O95858 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN15O95858 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN15O95858 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN15O95858 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN15O95858 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN15O95858 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN15O95858 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN15O95858 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN15O95858 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN15O95858 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSPAN15O95858 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms