Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLIC3O95833 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLIC3O95833 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIC3O95833 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms