Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MATN4O95460 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MATN4O95460 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MATN4O95460 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MATN4O95460 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MATN4O95460 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MATN4O95460 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MATN4O95460 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MATN4O95460 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MATN4O95460 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MATN4O95460 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MATN4O95460 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MATN4O95460 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MATN4O95460 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MATN4O95460 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MATN4O95460 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MATN4O95460 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MATN4O95460 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MATN4O95460 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MATN4O95460 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MATN4O95460 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MATN4O95460 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MATN4O95460 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MATN4O95460 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MATN4O95460 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MATN4O95460 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MATN4O95460 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MATN4O95460 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MATN4O95460 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MATN4O95460 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MATN4O95460 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MATN4O95460 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MATN4O95460 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MATN4O95460 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MATN4O95460 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MATN4O95460 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MATN4O95460 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MATN4O95460 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MATN4O95460 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MATN4O95460 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MATN4O95460 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MATN4O95460 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MATN4O95460 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MATN4O95460 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MATN4O95460 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MATN4O95460 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MATN4O95460 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MATN4O95460 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MATN4O95460 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MATN4O95460 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MATN4O95460 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MATN4O95460 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MATN4O95460 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MATN4O95460 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MATN4O95460 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MATN4O95460 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MATN4O95460 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MATN4O95460 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MATN4O95460 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MATN4O95460 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MATN4O95460 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MATN4O95460 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MATN4O95460 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MATN4O95460 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MATN4O95460 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MATN4O95460 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MATN4O95460 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MATN4O95460 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MATN4O95460 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MATN4O95460 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MATN4O95460 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MATN4O95460 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MATN4O95460 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MATN4O95460 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MATN4O95460 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MATN4O95460 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MATN4O95460 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MATN4O95460 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MATN4O95460 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MATN4O95460 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MATN4O95460 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MATN4O95460 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MATN4O95460 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MATN4O95460 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MATN4O95460 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MATN4O95460 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MATN4O95460 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MATN4O95460 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MATN4O95460 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MATN4O95460 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MATN4O95460 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MATN4O95460 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN4O95460 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN4O95460 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MATN4O95460 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MATN4O95460 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MATN4O95460 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MATN4O95460 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN4O95460 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MATN4O95460 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms