Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATE1O95260 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATE1O95260 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATE1O95260 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATE1O95260 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATE1O95260 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATE1O95260 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATE1O95260 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATE1O95260 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATE1O95260 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATE1O95260 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATE1O95260 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATE1O95260 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATE1O95260 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATE1O95260 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATE1O95260 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATE1O95260 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATE1O95260 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATE1O95260 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATE1O95260 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATE1O95260 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATE1O95260 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATE1O95260 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATE1O95260 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATE1O95260 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATE1O95260 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATE1O95260 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATE1O95260 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATE1O95260 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATE1O95260 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATE1O95260 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATE1O95260 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATE1O95260 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATE1O95260 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATE1O95260 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATE1O95260 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATE1O95260 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATE1O95260 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATE1O95260 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATE1O95260 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATE1O95260 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATE1O95260 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATE1O95260 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATE1O95260 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATE1O95260 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATE1O95260 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATE1O95260 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATE1O95260 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATE1O95260 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATE1O95260 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATE1O95260 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATE1O95260 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATE1O95260 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATE1O95260 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATE1O95260 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATE1O95260 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATE1O95260 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATE1O95260 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATE1O95260 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATE1O95260 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATE1O95260 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATE1O95260 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATE1O95260 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATE1O95260 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATE1O95260 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATE1O95260 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATE1O95260 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATE1O95260 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATE1O95260 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATE1O95260 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATE1O95260 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATE1O95260 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATE1O95260 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATE1O95260 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATE1O95260 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATE1O95260 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATE1O95260 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATE1O95260 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATE1O95260 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ATE1O95260 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATE1O95260 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATE1O95260 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATE1O95260 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATE1O95260 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATE1O95260 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATE1O95260 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATE1O95260 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATE1O95260 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATE1O95260 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATE1O95260 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATE1O95260 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATE1O95260 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATE1O95260 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATE1O95260 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATE1O95260 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATE1O95260 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATE1O95260 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATE1O95260 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATE1O95260 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATE1O95260 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms