Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABARAPO95166 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABARAPO95166 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABARAPO95166 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GABARAPO95166 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPO95166 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms